Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGA3

Slc43a2, Large neutral amino acids transporter small subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a2Q8CGA3 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Trim59-201ENSMUST00000107802 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Crem-201ENSMUST00000025069 2931 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Mir124-2hg-206ENSMUST00000189754 525 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Kcng1-201ENSMUST00000099069 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Slc43a2Q8CGA3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms