Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Vasp-201ENSMUST00000032561 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Emb-201ENSMUST00000022242 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Usp1-202ENSMUST00000091358 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Mzf1-204ENSMUST00000182490 2872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Tmem218-201ENSMUST00000034632 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Etl4-208ENSMUST00000114614 5898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Nup88Q8CEC0 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms