Protein–RNA interactions for Protein: Q8CAS9

Parp9, Poly [ADP-ribose] polymerase 9, mousemouse

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp9Q8CAS9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Anks1b-213ENSMUST00000182284 2607 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Parp9Q8CAS9 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms