Protein–RNA interactions for Protein: Q8C6J9

Nlrp4b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 4B, mousemouse

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Length 863 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp4bQ8C6J9 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Nlrp4bQ8C6J9 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Olfr56-201ENSMUST00000056759 1925 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 CT030684.3-201ENSMUST00000227308 2445 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Plekhn1-201ENSMUST00000105569 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Styxl1-207ENSMUST00000177559 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Mpv17-203ENSMUST00000200833 1171 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Nlrp4bQ8C6J9 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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