Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Sp7-201ENSMUST00000078508 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Bcl2l1-202ENSMUST00000109820 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Megf6-201ENSMUST00000030897 6851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Mmp28-202ENSMUST00000103209 3438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap28-201ENSMUST00000024840 5322 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Rgs12-202ENSMUST00000087684 4713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Mllt6-202ENSMUST00000107586 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 2900089D17Rik-201ENSMUST00000124015 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pdcl3Q8BVF2 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Pex12-207ENSMUST00000176518 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Psph-201ENSMUST00000031399 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Akna-201ENSMUST00000035724 5387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Hk1-205ENSMUST00000130422 2916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Chp1-201ENSMUST00000014221 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm35082-201ENSMUST00000207308 338 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Pygo2-202ENSMUST00000107413 2911 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Sbsn-201ENSMUST00000080518 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 2810430I11Rik-201ENSMUST00000154246 3416 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Slc52a2-201ENSMUST00000023220 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Pou4f3-201ENSMUST00000025374 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Pdcl3Q8BVF2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.1 ms