Protein–RNA interactions for Protein: Q8BP56

Pgghg, Protein-glucosylgalactosylhydroxylysine glucosidase, mousemouse

Predictions only

Length 690 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PgghgQ8BP56 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Grtp1-206ENSMUST00000210317 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PgghgQ8BP56 Sirt2-201ENSMUST00000072965 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
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PgghgQ8BP56 Tmem215-202ENSMUST00000179526 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PgghgQ8BP56 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm26604-201ENSMUST00000180926 1766 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Lypd6-201ENSMUST00000053208 3620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Maged2-204ENSMUST00000112700 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PgghgQ8BP56 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PgghgQ8BP56 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PgghgQ8BP56 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PgghgQ8BP56 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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PgghgQ8BP56 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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PgghgQ8BP56 Glmn-202ENSMUST00000082121 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 D930019O06Rik-201ENSMUST00000181841 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Ankrd6-204ENSMUST00000084750 4444 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
PgghgQ8BP56 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms