Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMI3

Gga3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, mousemouse

Predictions only

Length 718 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gga3Q8BMI3 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gga3Q8BMI3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gga3Q8BMI3 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gga3Q8BMI3 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Gga3Q8BMI3 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gga3Q8BMI3 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gga3Q8BMI3 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gga3Q8BMI3 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gga3Q8BMI3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gga3Q8BMI3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Gga3Q8BMI3 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gga3Q8BMI3 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Gga3Q8BMI3 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Gga3Q8BMI3 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gga3Q8BMI3 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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