Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW9

Slfnl1, Schlafen-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slfnl1Q8BHW9 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Alkbh4-202ENSMUST00000100568 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Mageb10-ps-201ENSMUST00000119697 1407 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Arl5c-202ENSMUST00000107563 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Gm30906-201ENSMUST00000219578 535 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Mdk-203ENSMUST00000090602 714 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Cxadr-202ENSMUST00000114229 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Pkig-203ENSMUST00000109400 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Gm19309-201ENSMUST00000218295 205 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 AC153938.1-201ENSMUST00000220354 1425 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Creld2-201ENSMUST00000024042 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Ddx27-201ENSMUST00000018143 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 4933409G03Rik-201ENSMUST00000102713 1263 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 6330418K02Rik-201ENSMUST00000124298 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Hypk-204ENSMUST00000126764 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Gm27772-201ENSMUST00000184900 187 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Gm36634-201ENSMUST00000218356 1259 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 AC154276.1-201ENSMUST00000228874 1299 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Eaf2-201ENSMUST00000023537 849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Slfnl1Q8BHW9 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms