Protein–RNA interactions for Protein: Q80W65

Pcsk9, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 9, mousemouse

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk9Q80W65 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pcsk9Q80W65 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pcsk9Q80W65 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
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Pcsk9Q80W65 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pcsk9Q80W65 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Pcsk9Q80W65 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Cluh-202ENSMUST00000117818 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Mpp4-201ENSMUST00000066374 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Mpp4-202ENSMUST00000078874 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Saa1-201ENSMUST00000128088 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Pcsk9Q80W65 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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