Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm38102-201ENSMUST00000192791 1935 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm15851-201ENSMUST00000160564 662 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Fscn2-201ENSMUST00000026445 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Sgce-201ENSMUST00000004750 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Taf7l-201ENSMUST00000009740 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Pou5f2-201ENSMUST00000175955 1394 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Sectm1a-204ENSMUST00000106120 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Upk3bl-202ENSMUST00000111137 1119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm11523-203ENSMUST00000184482 802 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm37885-201ENSMUST00000192568 1391 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm43714-201ENSMUST00000198351 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm5565-201ENSMUST00000199463 1162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 AC158516.1-201ENSMUST00000213921 205 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 AC134254.1-201ENSMUST00000221362 167 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Otud6a-201ENSMUST00000060241 873 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Krt40-201ENSMUST00000074253 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Rasgrp2-207ENSMUST00000113475 573 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm43303-201ENSMUST00000200133 669 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm16372-201ENSMUST00000073088 450 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 BC039966-201ENSMUST00000141582 1371 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm43068-201ENSMUST00000201095 1273 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Vwa3b-202ENSMUST00000067178 1769 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm43579-201ENSMUST00000202387 1307 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 A430005L14Rik-202ENSMUST00000105645 977 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Rab3a-203ENSMUST00000110092 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm12997-201ENSMUST00000120207 640 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm12363-201ENSMUST00000122250 668 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 BC046401-201ENSMUST00000155786 847 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
NischQ80TM9 Gm44069-201ENSMUST00000204898 506 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
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