Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH7

Kcnf1, Potassium voltage-gated channel subfamily F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnf1Q7TSH7 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Mpp4-210ENSMUST00000191200 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Smg5-201ENSMUST00000001451 4448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tmem186-201ENSMUST00000052505 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Camk2d-206ENSMUST00000106402 4180 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Nrf1-211ENSMUST00000115212 3584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Slco4a1-202ENSMUST00000038259 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Nmral1-204ENSMUST00000120056 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Hnrnpf-210ENSMUST00000180341 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Astl-202ENSMUST00000089673 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tmc6-201ENSMUST00000026659 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gpr19-204ENSMUST00000116515 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tjap1-203ENSMUST00000180283 2368 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pou2af1-201ENSMUST00000034554 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Klhl26-205ENSMUST00000210250 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Neurl3-201ENSMUST00000056946 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Mypn-202ENSMUST00000218978 1833 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Miga2-208ENSMUST00000140075 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Sema6c-201ENSMUST00000090821 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Chrna10-201ENSMUST00000084830 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm43423-201ENSMUST00000198390 2094 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Pdxk-ps-201ENSMUST00000159650 2342 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Vegfa-202ENSMUST00000071648 3451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Kcnf1Q7TSH7 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Kcnf1Q7TSH7 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
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