Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSH4

Ccp110, Centriolar coiled-coil protein of 110 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccp110Q7TSH4 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccp110Q7TSH4 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccp110Q7TSH4 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccp110Q7TSH4 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccp110Q7TSH4 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Ildr2-201ENSMUST00000111416 8251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Thap2-202ENSMUST00000218842 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Pip5k1c-201ENSMUST00000045469 4323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm12882-201ENSMUST00000121696 517 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gigyf2-201ENSMUST00000027475 5724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Secisbp2l-201ENSMUST00000053699 6797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccp110Q7TSH4 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms