Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMV1

Rnf139, E3 ubiquitin-protein ligase RNF139, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf139Q7TMV1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rnf139Q7TMV1 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Gm9347-201ENSMUST00000211473 1607 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Ube2g1-203ENSMUST00000138247 3931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 AC131690.1-201ENSMUST00000218406 374 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Gm9229-201ENSMUST00000222777 126 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Lce1d-201ENSMUST00000029524 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Dctn6-201ENSMUST00000033913 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Cnot7-201ENSMUST00000034012 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Rnf139Q7TMV1 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms