Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB8

Zcchc2, Zinc finger CCHC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc2Q69ZB8 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Msh2-201ENSMUST00000024967 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Rad52-201ENSMUST00000032269 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 AC090659.2-201ENSMUST00000225378 1186 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Zcchc2Q69ZB8 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms