Protein–RNA interactions for Protein: Q62388

Atm, Serine-protein kinase ATM, mousemouse

Predictions only

Length 3,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtmQ62388 H2-M10.2-201ENSMUST00000023845 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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AtmQ62388 Atpif1-201ENSMUST00000067496 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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AtmQ62388 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
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AtmQ62388 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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AtmQ62388 Tomt-202ENSMUST00000106970 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Nfyc-201ENSMUST00000043429 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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AtmQ62388 Smarcd2-203ENSMUST00000106843 2548 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 Gm25732-201ENSMUST00000175168 60 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
AtmQ62388 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms