Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 9230020A06Rik-204ENSMUST00000215201 1116 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Hipk4-202ENSMUST00000108353 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm8565-201ENSMUST00000183259 1014 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm867-202ENSMUST00000219979 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm8810-201ENSMUST00000172895 754 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm38223-201ENSMUST00000194484 695 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Tomm7-201ENSMUST00000030851 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Egfl7-208ENSMUST00000149789 683 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm14379-201ENSMUST00000128858 1878 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Igsf5-202ENSMUST00000081093 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm13834-201ENSMUST00000123757 137 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm22331-201ENSMUST00000158066 136 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Ppm1h-208ENSMUST00000162969 811 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Oprm1-214ENSMUST00000105605 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Oprm1-201ENSMUST00000000783 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Abhd6-202ENSMUST00000166497 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Gm28729-201ENSMUST00000190704 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
Sall3Q62255 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sall3Q62255 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sall3Q62255 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sall3Q62255 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sall3Q62255 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sall3Q62255 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Sall3Q62255 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sall3Q62255 Trip4-201ENSMUST00000117083 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sall3Q62255 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sall3Q62255 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Sall3Q62255 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms