Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

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Length 310 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 AC126253.1-201ENSMUST00000227974 824 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 Nt5c2-202ENSMUST00000168536 3769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Usf1Q61069 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
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Usf1Q61069 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
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Usf1Q61069 Gm40466-201ENSMUST00000212174 422 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Ppp1r14d-201ENSMUST00000076084 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Usf1Q61069 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms