Protein–RNA interactions for Protein: Q60636

Prdm1, PR domain zinc finger protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prdm1Q60636 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm30934-201ENSMUST00000215803 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Pxylp1-204ENSMUST00000120101 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Prdm1Q60636 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Prdm1Q60636 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms