Protein–RNA interactions for Protein: Q60598

Cttn, Src substrate cortactin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CttnQ60598 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Uts2-201ENSMUST00000030803 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CttnQ60598 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Snhg17-201ENSMUST00000133449 933 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Gm6916-202ENSMUST00000205523 195 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Ankrd23-202ENSMUST00000193083 2277 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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CttnQ60598 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Fgfr1op2-201ENSMUST00000037836 687 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Mettl26-204ENSMUST00000169085 324 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
CttnQ60598 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
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