Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Arnt-203ENSMUST00000102749 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Trib1-202ENSMUST00000118228 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Bap1-201ENSMUST00000022458 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Esyt3-201ENSMUST00000042158 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Zhx2-201ENSMUST00000096430 4376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Acsl6-210ENSMUST00000108905 5807 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Fam110b-209ENSMUST00000171403 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Fam43a-201ENSMUST00000059078 3075 ntAPPRIS P1 BASIC11.54□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Mul1-201ENSMUST00000044058 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 2610001J05Rik-203ENSMUST00000185219 1606 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Aco1-201ENSMUST00000102973 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Afdn-216ENSMUST00000170827 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Dph3-202ENSMUST00000067955 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Irak3-201ENSMUST00000020448 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Tbc1d9b-201ENSMUST00000093138 4407 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm7002-201ENSMUST00000221386 2165 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Fam131b-202ENSMUST00000095974 3992 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Colgalt1-201ENSMUST00000047903 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Il11ra1-203ENSMUST00000108041 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Nek6-203ENSMUST00000112902 3147 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
Sft2d1Q5SSN7 Gm26841-201ENSMUST00000180725 1787 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Ppcdc-209ENSMUST00000214624 1814 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Stau2-215ENSMUST00000162435 2735 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 St6gal1-201ENSMUST00000023601 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Dok7-203ENSMUST00000114270 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Lrrfip1-204ENSMUST00000097650 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC11.52□□□□□ -0.57
Sft2d1Q5SSN7 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.7 ms