Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSI6

Utp18, U3 small nucleolar RNA-associated protein 18 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp18Q5SSI6 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Esrrb-202ENSMUST00000110203 2363 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Rbak-201ENSMUST00000049861 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gpsm1-204ENSMUST00000114134 2043 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Pja1-203ENSMUST00000113792 3038 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Ngef-201ENSMUST00000027477 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Kif3a-208ENSMUST00000173744 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 1700037C18Rik-202ENSMUST00000115859 2592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Wrap53-201ENSMUST00000048139 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Men1-202ENSMUST00000078137 2738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 E230013L22Rik-201ENSMUST00000180408 1856 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Mboat2-201ENSMUST00000078902 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Utp18Q5SSI6 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Utp18Q5SSI6 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms