Protein–RNA interactions for Protein: Q5SP85

Ccdc85a, Coiled-coil domain-containing protein 85A, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85aQ5SP85 Tmem55a-201ENSMUST00000029875 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm13562-201ENSMUST00000125198 797 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm38671-201ENSMUST00000200573 130 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Wdr83-201ENSMUST00000093357 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Sh2d5-202ENSMUST00000105824 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc85aQ5SP85 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Wisp1-202ENSMUST00000118823 708 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 St6galnac6-209ENSMUST00000131229 1013 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Selenoh-205ENSMUST00000189636 499 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm34084-201ENSMUST00000222236 1298 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm15376-201ENSMUST00000122258 783 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Agtpbp1-213ENSMUST00000167096 508 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm26618-201ENSMUST00000181123 497 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm5069-202ENSMUST00000192714 1011 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Tex13c2-201ENSMUST00000197237 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Cul7-201ENSMUST00000043464 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc85aQ5SP85 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms