Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Bdh1-202ENSMUST00000115226 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir3547-201ENSMUST00000175461 88 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7172-201ENSMUST00000218047 1152 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 CT030704.2-201ENSMUST00000228887 494 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Crybb2-202ENSMUST00000112336 906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Map2k6-202ENSMUST00000100260 2088 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Serpinh1-201ENSMUST00000094154 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Apbb1-212ENSMUST00000189072 2085 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Abhd14b-202ENSMUST00000185347 1200 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufs6-201ENSMUST00000022097 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 AC150560.1-201ENSMUST00000227731 1187 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm9109-201ENSMUST00000120254 1405 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Acp5-202ENSMUST00000115315 1349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgfr1op-202ENSMUST00000097419 3505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm2445-201ENSMUST00000182798 989 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gnas-210ENSMUST00000109095 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ccdc88aQ5SNZ0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms