Protein–RNA interactions for Protein: Q5HZG4

Taf3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 932 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf3Q5HZG4 Gnaz-202ENSMUST00000159991 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Ptp4a3-204ENSMUST00000167582 2640 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Mfge8-202ENSMUST00000107409 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Pik3ip1-201ENSMUST00000045153 2573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Aida-201ENSMUST00000109166 4279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Fam155a-201ENSMUST00000110969 3388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Pfkl-201ENSMUST00000020522 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Zfp236-201ENSMUST00000171071 9626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Tbkbp1-205ENSMUST00000118375 3288 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Irx6-201ENSMUST00000034185 3370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Celf5-201ENSMUST00000118763 4391 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Epha8-201ENSMUST00000030420 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 5830432E09Rik-203ENSMUST00000210953 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Mrpl3-201ENSMUST00000035177 3972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Taf3Q5HZG4 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Mnt-201ENSMUST00000000291 4590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Pbrm1-203ENSMUST00000052239 5065 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Taf3Q5HZG4 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41 ms