Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZT31

Snx25, Sorting nexin-25, mousemouse

Predictions only

Length 840 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx25Q3ZT31 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm7730-201ENSMUST00000212486 454 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Zfp618-203ENSMUST00000107415 8826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Ralgds-201ENSMUST00000028170 3590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Rnf151-201ENSMUST00000008626 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Snx25Q3ZT31 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms