Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2C1

Krtap9-3, Keratin-associated protein 9-3, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap9-3Q3V2C1 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 AC140406.1-201ENSMUST00000226481 465 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm9826-201ENSMUST00000029124 1299 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 BC049730-201ENSMUST00000051714 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm29590-201ENSMUST00000190396 1304 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Mff-201ENSMUST00000073025 1706 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Rpl15-203ENSMUST00000100799 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm22018-201ENSMUST00000104357 131 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 C430049B03Rik-201ENSMUST00000129764 868 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm12843-201ENSMUST00000137607 601 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 4930471M09Rik-201ENSMUST00000181849 1112 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm37008-201ENSMUST00000195712 319 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Rnf212-202ENSMUST00000196652 853 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm7118-201ENSMUST00000200167 1003 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 2900064F13Rik-201ENSMUST00000202166 1008 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Olfr1460-ps1-201ENSMUST00000208975 899 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Ins2-209ENSMUST00000210288 918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm17823-201ENSMUST00000217830 1006 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm7745-202ENSMUST00000222914 567 ntTSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.69□□□□□ -1.5
Krtap9-3Q3V2C1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.4 ms