Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rcsd1-202ENSMUST00000097474 5001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Myo10-201ENSMUST00000022882 5880 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Cobl-208ENSMUST00000172919 2566 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Eme2-201ENSMUST00000119848 5226 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Aqr-201ENSMUST00000043160 4888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Trim34a-202ENSMUST00000106848 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Smpd3-201ENSMUST00000067512 5148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Adam11-202ENSMUST00000103081 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Nlrc3-203ENSMUST00000177551 5403 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Arfip2-206ENSMUST00000131446 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm42748-201ENSMUST00000199354 2341 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Syt10-201ENSMUST00000029441 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Arhgap11a-203ENSMUST00000110948 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm8584-201ENSMUST00000171982 758 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Samhd1-202ENSMUST00000088523 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ahcyl2-201ENSMUST00000064872 2019 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Ermard-202ENSMUST00000061688 2120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rdh10-201ENSMUST00000027053 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45638-201ENSMUST00000211507 2878 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
4930596D02RikQ3V0H9 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms