Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWL8

Pfdn4, Prefoldin subunit 4, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn4Q3UWL8 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Pfdn4Q3UWL8 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Smim14-205ENSMUST00000139122 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gdap1l1-202ENSMUST00000109420 2475 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ripk4-201ENSMUST00000019386 3541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Myo10-202ENSMUST00000110457 8125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pfdn4Q3UWL8 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Prrc2b-201ENSMUST00000036691 8612 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Pfdn4Q3UWL8 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Dnmt3a-201ENSMUST00000020991 9685 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Nr2f1-205ENSMUST00000150498 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pfdn4Q3UWL8 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pfdn4Q3UWL8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Pfdn4Q3UWL8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Pcyox1-201ENSMUST00000032065 4295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Paox-201ENSMUST00000026537 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Rnf135-201ENSMUST00000017839 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 D430019H16Rik-201ENSMUST00000178224 5786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Spg20-201ENSMUST00000044116 3770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Pfdn4Q3UWL8 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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