Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Stk38-202ENSMUST00000119274 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Tm7sf2-203ENSMUST00000159084 1351 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Rtn3-203ENSMUST00000088169 1709 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Oasl1-202ENSMUST00000112143 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Tspan12-202ENSMUST00000120965 2157 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Tmem176b-201ENSMUST00000101429 1238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Ppp1r18-205ENSMUST00000187690 3185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Tesmin-202ENSMUST00000127142 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Rnf224-202ENSMUST00000205192 1707 ntAPPRIS P1 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Cenpt-201ENSMUST00000040776 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Hcrtr1-202ENSMUST00000119423 2439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.25□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.25□□□□□ -0.45
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Gm6899Q3USS0 Osbpl9-202ENSMUST00000084366 3134 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Nedd8-201ENSMUST00000010520 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Syt8-204ENSMUST00000118276 1503 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Samd4-203ENSMUST00000125113 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm6899Q3USS0 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Tnfaip8-207ENSMUST00000148159 1921 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Gm44719-201ENSMUST00000206404 149 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
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Gm6899Q3USS0 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Alkbh3os1-201ENSMUST00000028621 1549 ntTSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 2310002L09Rik-201ENSMUST00000030101 958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Msantd3-201ENSMUST00000061135 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Serpinb2-201ENSMUST00000009356 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.24□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.45
Gm6899Q3USS0 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.23□□□□□ -0.45
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