Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Il11-201ENSMUST00000094892 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Osbpl10-204ENSMUST00000182384 2158 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Tmed5-202ENSMUST00000061203 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Asap1-216ENSMUST00000177083 4415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Lsm14b-202ENSMUST00000058764 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Dhdds-204ENSMUST00000105887 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Aldh1a2-201ENSMUST00000034723 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Hp1bp3-204ENSMUST00000105826 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Trim80-201ENSMUST00000093914 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Slc16a13-201ENSMUST00000060010 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Olfr160-203ENSMUST00000215727 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 0610005C13Rik-201ENSMUST00000209416 856 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 AC139350.3-201ENSMUST00000226151 420 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm28047Q3US59 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.5 ms