Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC9.71□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.71□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.71□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Phldb1-210ENSMUST00000134465 5244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Abl2-201ENSMUST00000027888 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm9719-201ENSMUST00000162765 543 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Cfap99-201ENSMUST00000207754 2123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.7□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Mocs1-204ENSMUST00000173033 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Cxcl16-201ENSMUST00000019064 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Slc25a19-212ENSMUST00000178003 2614 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
E130208F15RikQ3UPV3 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.69□□□□□ -0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms