Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 1700012C08Rik-201ENSMUST00000141554 363 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Tmtc3-202ENSMUST00000099318 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Tmem181b-ps-203ENSMUST00000188746 1626 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc10-201ENSMUST00000073834 1428 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 AU022133-201ENSMUST00000200601 873 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm6082-201ENSMUST00000215204 454 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Fbxw7-201ENSMUST00000029727 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Sf3b2Q3UJB0 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm11638-201ENSMUST00000153672 1615 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Rpl17-ps5-201ENSMUST00000121001 555 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm12315-201ENSMUST00000151599 911 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Rps4l-202ENSMUST00000204242 789 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Timm9-203ENSMUST00000220482 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Rps5-201ENSMUST00000004554 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Krtap4-7-201ENSMUST00000055121 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sf3b2Q3UJB0 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.9 ms