Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K5

Kdm4d, Lysine-specific demethylase 4D, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm4dQ3U2K5 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 F420014N23Rik-201ENSMUST00000181578 2396 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm28760-201ENSMUST00000185995 736 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 H2-Bl-210ENSMUST00000195833 829 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Rbbp8nl-201ENSMUST00000038529 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm15393-201ENSMUST00000120499 219 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h3h-201ENSMUST00000188775 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Hist1h3i-201ENSMUST00000189457 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Kdm4dQ3U2K5 Cdk8-205ENSMUST00000161181 2467 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms