Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0M1

Trappc9, Trafficking protein particle complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc9Q3U0M1 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gdap1l1-201ENSMUST00000018087 2220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm44608-201ENSMUST00000206827 855 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm37019-201ENSMUST00000192133 2134 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Pdlim2-210ENSMUST00000153735 1578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Pigyl-201ENSMUST00000123680 695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Trappc9Q3U0M1 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms