Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Sh3bp5-202ENSMUST00000100730 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Pbx2-205ENSMUST00000183827 1186 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Slfn2-201ENSMUST00000038038 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Ckmt1-202ENSMUST00000078222 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Il15-201ENSMUST00000034148 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cmpk1-201ENSMUST00000030491 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ccndbp1Q3TVC7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Osm-201ENSMUST00000075221 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Rims1-201ENSMUST00000081544 5954 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Nr2f1-202ENSMUST00000125176 841 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Aqp10-ps-201ENSMUST00000199555 611 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Six3os1-211ENSMUST00000176958 2889 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Prickle3-203ENSMUST00000129662 2376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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