Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 Comt-201ENSMUST00000000335 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Tas2r137-201ENSMUST00000064932 1073 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Aldh3b1-201ENSMUST00000051803 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Oscar-202ENSMUST00000108645 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Oscar-201ENSMUST00000039507 1823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Ndufs5-202ENSMUST00000106206 599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Men1-210ENSMUST00000166909 295 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm5741-201ENSMUST00000177563 328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm7783-201ENSMUST00000204795 781 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Ccdc190-201ENSMUST00000094348 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Mmp21-201ENSMUST00000033278 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm6203-201ENSMUST00000209575 1342 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 1700045I11Rik-201ENSMUST00000194752 493 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm12020-201ENSMUST00000119030 2042 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Ppp1r3g-201ENSMUST00000132661 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm10146-201ENSMUST00000072739 309 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Map2k7-203ENSMUST00000110994 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 B230319C09Rik-201ENSMUST00000063376 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Slc5a2-202ENSMUST00000118169 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Thoc6-204ENSMUST00000115490 1157 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Gm17344-201ENSMUST00000171173 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Nkiras2-202ENSMUST00000051947 831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Krtap19-2-201ENSMUST00000076186 605 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Shroom4Q1W617 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms