Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Pank1-201ENSMUST00000036584 3460 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Clic6-201ENSMUST00000023670 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Cpt2-201ENSMUST00000030345 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 2410002F23Rik-203ENSMUST00000084937 2092 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Myo19-202ENSMUST00000093969 4091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm9951-202ENSMUST00000149618 1772 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm7114-201ENSMUST00000190159 1789 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gm18041-201ENSMUST00000218210 618 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Gtf2i-206ENSMUST00000172715 4114 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpa1-201ENSMUST00000036004 1918 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Cyp11a1-201ENSMUST00000034874 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Itgb8Q0VBD0 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Itgb8Q0VBD0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms