Protein–RNA interactions for Protein: Q0GA42

Cnnm1, Metal transporter CNNM1, mousemouse

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm1Q0GA42 AC114543.1-201ENSMUST00000226451 1558 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Pcna-201ENSMUST00000028817 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 B3gntl1-201ENSMUST00000062654 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Nr1d1-201ENSMUST00000064941 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Rbm42-201ENSMUST00000042726 1784 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm15557-201ENSMUST00000109629 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm6266-201ENSMUST00000203844 806 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Mecp2-203ENSMUST00000123362 1675 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Gm32926-202ENSMUST00000215162 1176 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cnnm1Q0GA42 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnnm1Q0GA42 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnnm1Q0GA42 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnnm1Q0GA42 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnnm1Q0GA42 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnnm1Q0GA42 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnnm1Q0GA42 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cnnm1Q0GA42 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cnnm1Q0GA42 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms