Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Adgrb2-206ENSMUST00000106018 4470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pou6f1Q07916 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Pou6f1Q07916 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
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Pou6f1Q07916 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pou6f1Q07916 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pou6f1Q07916 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Chrnb1-201ENSMUST00000045971 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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Pou6f1Q07916 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pou6f1Q07916 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pou6f1Q07916 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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Pou6f1Q07916 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pou6f1Q07916 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pou6f1Q07916 Sar1b-201ENSMUST00000020653 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Gnao1-203ENSMUST00000125716 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Pou6f1Q07916 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Pou6f1Q07916 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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