Protein–RNA interactions for Protein: Q06649

Sh3bp2, SH3 domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp2Q06649 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Pbx2-203ENSMUST00000173328 1990 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Zfp977-201ENSMUST00000173283 1425 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 C130080G10Rik-203ENSMUST00000154140 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Adal-204ENSMUST00000110665 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Kcnq2-207ENSMUST00000103050 2713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Atat1-201ENSMUST00000056034 1930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Cdsn-201ENSMUST00000044804 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Atpaf2-201ENSMUST00000108721 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Slc52a3-204ENSMUST00000109861 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm13589-201ENSMUST00000146404 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sh3bp2Q06649 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms