Protein–RNA interactions for Protein: Q02067

Ascl1, Achaete-scute homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl1Q02067 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 P3h2-201ENSMUST00000039990 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gm38294-201ENSMUST00000192831 381 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Fasn-201ENSMUST00000055655 10050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Rfc3-201ENSMUST00000038131 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Myo1d-201ENSMUST00000041065 5354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Me1-201ENSMUST00000034989 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Dyx1c1-202ENSMUST00000098567 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Arhgef40-201ENSMUST00000093813 5621 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Kbtbd7-201ENSMUST00000061222 4526 ntAPPRIS P1 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Prox1-201ENSMUST00000010319 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Ascl1Q02067 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms