Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

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Length 594 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Mdga2-201ENSMUST00000037181 9833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RykQ01887 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RykQ01887 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.27
RykQ01887 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RykQ01887 Pgd-201ENSMUST00000084124 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RykQ01887 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RykQ01887 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
RykQ01887 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Gm18049-201ENSMUST00000208909 581 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Mtdh-201ENSMUST00000022865 6919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 C530008M17Rik-204ENSMUST00000121160 6921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
RykQ01887 Lgi3-201ENSMUST00000047331 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Madd-201ENSMUST00000066420 3753 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Eloa-201ENSMUST00000030427 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
RykQ01887 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
RykQ01887 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms