Protein–RNA interactions for Protein: Q01405

Sec23a, Protein transport protein Sec23A, mousemouse

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23aQ01405 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gnb2-215ENSMUST00000170293 993 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm29741-201ENSMUST00000192667 421 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 AC149294.4-201ENSMUST00000227870 882 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Immp2l-201ENSMUST00000080160 239 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Mocs2-208ENSMUST00000166176 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Tcf4-258ENSMUST00000202937 2103 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ccne2-202ENSMUST00000108324 2908 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 C330018A13Rik-201ENSMUST00000127792 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm11557-201ENSMUST00000120200 1008 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm13385-201ENSMUST00000121089 220 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ccdc24-209ENSMUST00000171052 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm8927-201ENSMUST00000181978 981 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm3222-201ENSMUST00000071282 990 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Pnpla2-203ENSMUST00000164016 2625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ash2l-202ENSMUST00000110608 2134 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 2900005J15Rik-202ENSMUST00000171190 2025 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Syncrip-209ENSMUST00000174361 1767 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Kcnj3-203ENSMUST00000112633 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Syvn1-201ENSMUST00000025723 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Fam53b-205ENSMUST00000106166 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm11723-201ENSMUST00000155505 466 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gm3809-201ENSMUST00000180973 1006 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Camk2b-203ENSMUST00000066431 1603 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sec23aQ01405 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms