Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Gm44064-201ENSMUST00000204964 1087 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Plekha1-201ENSMUST00000048180 3321 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm12404-201ENSMUST00000122839 1661 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Armcx1-204ENSMUST00000113198 2085 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Asb2-201ENSMUST00000021617 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Cant1-203ENSMUST00000106287 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Zfp157-202ENSMUST00000100524 869 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm8801-201ENSMUST00000173255 1064 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gm35409-201ENSMUST00000196412 1102 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Hspb2-201ENSMUST00000042790 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Top2aQ01320 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Mfn2-202ENSMUST00000105714 2427 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gpr12-203ENSMUST00000197431 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Rwdd3-209ENSMUST00000170781 1111 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Lsmem2-201ENSMUST00000191791 369 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Atrip-201ENSMUST00000045011 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Erich1-201ENSMUST00000110813 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Kyat1-205ENSMUST00000113662 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Zfp853-201ENSMUST00000180336 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Spata3-202ENSMUST00000113344 1047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm15336-201ENSMUST00000128894 1571 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm45233-201ENSMUST00000203633 898 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Coro6-203ENSMUST00000079770 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Tldc2-201ENSMUST00000099140 608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm18630-201ENSMUST00000222109 1397 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm26850-201ENSMUST00000181653 2669 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Dda1-206ENSMUST00000138892 1738 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm11618-201ENSMUST00000117946 267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm12384-201ENSMUST00000119228 919 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm11791-201ENSMUST00000139327 336 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm43133-201ENSMUST00000197472 463 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Capg-201ENSMUST00000071044 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Troap-201ENSMUST00000039665 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 4930579G24Rik-201ENSMUST00000029388 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Ccdc134-201ENSMUST00000089174 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Rhox2f-201ENSMUST00000115173 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Top2aQ01320 Gm16229-201ENSMUST00000133270 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms