Protein–RNA interactions for Protein: Q01279

Egfr, Epidermal growth factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 1,210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EgfrQ01279 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Zscan22-203ENSMUST00000119989 2087 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm26083-201ENSMUST00000157904 193 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Creb3-206ENSMUST00000167751 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Il15-202ENSMUST00000209363 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Ormdl2-204ENSMUST00000219524 724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Mien1-201ENSMUST00000002655 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Zfp707-201ENSMUST00000109966 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm12349-201ENSMUST00000153030 657 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 AC167229.2-201ENSMUST00000218902 675 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm18473-201ENSMUST00000220543 868 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 AC166997.1-201ENSMUST00000225122 572 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 1810062G17Rik-201ENSMUST00000029268 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EgfrQ01279 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Rpl3-ps2-201ENSMUST00000117131 1214 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Cd180-203ENSMUST00000170878 842 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Cd180-205ENSMUST00000172138 518 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Aif1-206ENSMUST00000173324 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm5850-201ENSMUST00000192923 1206 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 St13-201ENSMUST00000023039 1089 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gng8-201ENSMUST00000078182 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Slc29a1-203ENSMUST00000097317 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Pdia2-201ENSMUST00000039113 1721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Mir877-201ENSMUST00000104738 85 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Dhrs3-202ENSMUST00000105744 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm12203-201ENSMUST00000118235 598 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm12209-201ENSMUST00000120089 596 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
EgfrQ01279 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.1 ms