Protein–RNA interactions for Protein: Q00724

Rbp4, Retinol-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbp4Q00724 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Diaph1-204ENSMUST00000115631 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm26534-201ENSMUST00000181687 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Elf3-201ENSMUST00000003135 2095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Grb10-201ENSMUST00000093321 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm28237-202ENSMUST00000189477 748 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ppcdc-205ENSMUST00000214144 724 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Prrc2a-201ENSMUST00000025253 6888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Socs5-201ENSMUST00000041369 4392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Mir7684-201ENSMUST00000183858 60 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Gabrg3-202ENSMUST00000068911 9767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Dnmt3b-204ENSMUST00000088976 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
Rbp4Q00724 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Nfasc-207ENSMUST00000187861 4927 ntTSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Rbp4Q00724 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.8 ms