Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Zdhhc23-201ENSMUST00000036321 1380 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Serpina11-202ENSMUST00000120251 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Pcnx3-201ENSMUST00000068169 5276 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Eef2kmt-201ENSMUST00000064635 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Atat1-203ENSMUST00000077494 1340 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Itga4Q00651 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 4930408O17Rik-202ENSMUST00000222624 1131 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Fbln7-201ENSMUST00000028864 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Casp16-ps-201ENSMUST00000088673 531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Kcp-201ENSMUST00000078112 4775 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Taok2-201ENSMUST00000071268 4720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Itga4Q00651 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms