Protein–RNA interactions for Protein: P70388

Rad50, DNA repair protein RAD50, mousemouse

Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad50P70388 AW822073-202ENSMUST00000204003 1959 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad50P70388 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad50P70388 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Trib2-204ENSMUST00000221518 1192 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Gm27680-201ENSMUST00000184192 160 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Elovl1-207ENSMUST00000167636 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Cnih4-203ENSMUST00000111059 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Dctn1-201ENSMUST00000077407 4118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Tpd52-203ENSMUST00000091355 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Gm37596-201ENSMUST00000193565 1021 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Zfp784-201ENSMUST00000062428 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Wdr45-225ENSMUST00000208443 1172 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Cep126-201ENSMUST00000037397 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Rad50P70388 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms