Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 9130008F23Rik-201ENSMUST00000068258 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vamp7P70280 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Ttll11-201ENSMUST00000028248 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vamp7P70280 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Phka2-202ENSMUST00000112376 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vamp7P70280 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Dusp14-203ENSMUST00000108101 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Gpc5-201ENSMUST00000022707 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 Pear1-205ENSMUST00000172621 4490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Vamp7P70280 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Vamp7P70280 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp7P70280 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp7P70280 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp7P70280 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Vamp7P70280 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Vamp7P70280 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms