Protein–RNA interactions for Protein: P62892

Rpl39, 60S ribosomal protein L39, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39P62892 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Rit1-201ENSMUST00000029692 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Esm1-201ENSMUST00000038144 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Vdac3-201ENSMUST00000009036 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mau2-202ENSMUST00000168013 5323 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ablim2-201ENSMUST00000054598 3564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mier3-203ENSMUST00000109272 5279 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ccdc151-201ENSMUST00000044926 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Xpr1-203ENSMUST00000111775 4094 ntTSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 C530008M17Rik-202ENSMUST00000120639 6826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Slc26a4-201ENSMUST00000001253 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Olfm1-202ENSMUST00000100244 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Myh3-203ENSMUST00000165221 5994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Rpl39P62892 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms